两者都比较好，只是作用于不同的场合。
酒精消毒液杀菌原理是让病菌的蛋白脱水，从而破坏细菌的细胞膜，使其蛋白凝固失去活性，而次氯酸消毒液杀菌原理主要是利用次氯酸的氧化能力，次氯酸分子小，不带电荷，还可渗入菌体内，与菌体蛋白、核酸和酶等有机高分子发生氧化反应，从而更快、更有效杀死细菌、病毒。
这两者消毒的原理不一样，因此作用的场合也不相同，所以不能说谁比谁好一些，需要看实际运用的场合。
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