两者用途有所不同，都是比较常用而且作用很好的消毒剂，它们适用于不同的场合。
次氯酸消毒液适用于物体表面、餐具、果蔬、室内空气、供水设备以及人体皮肤表面的消毒，次氯酸消毒液是一种含氯消毒液，在使用的时候不能接触皮肤，要戴好护具，如手套和口罩等。
酒精的主要成分是乙醇，乙醇能使病原微生物的蛋白质发生变性，从而杀死病原微生物，起到消毒杀菌的作用。酒精对人体没有刺激性，在使用时要避免与明火接触。
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