1.遗传性病因 结节病的临床表型和患病的种族差异的提示以及家族和并列对照研究证明肺部小结节病的发生与遗传因素密切相关。肺部小结节病的发生一部分来之遗传因素。 2.感染性病因 目前有一种学说认为肺部小结节病的发生与一种或多种病菌（伯氏疏螺旋体、戳疮丙酸杆菌、结合、其他分支杆菌）的感染有关，这种病菌感染性因素一直处在被证实阶段。

肺部小结节其实就是肺结节病，只是对肺结节病的大小定义。所谓肺结节病就是一种原因不明的多系统累及主要侵犯肺部及肺部其淋巴系统的肉芽肿性疾病。