埃博拉是人畜共通病毒，主要的感染途径是透过患者体液传染，如血液、汗、呕吐物、排泄物、尿液、唾液或精液等，目前并无飞沫感染的证据。

一旦有人与染有埃博拉的动物发生接触，就可能在社区造成人际传播。感染的发生源于与感染者的血液、其它体液或分泌物的直接接触。当健康人的破损皮肤或粘膜与受到埃博拉病人的感染性液体，如：脏衣物、床单或者用过的针头以及被污染的环境发生接触时，也可发生感染。尽管多个国家科研人员苦心研究，但至今仍没有找出任何有能力在爆发时存活的动物宿主，大多认为果蝠是可能是病毒的原宿主。