肝脏对蛋白质的代谢主要体现在两个方面，一个肝脏是蛋白质合成的重要器官，它可以合成白蛋白、凝血酶原以及一些免疫物质等，像白蛋白是血浆、胶体渗透压的重要物质，它就是维持血管里面和血管外面液体平衡的一个重要物质，像肝硬化的病人，因为白蛋白的降低会导致病人出现水肿。
还有肝脏是一些常见的凝血功能物质的合成重要器官，如果肝功能有问题，尤其是严重肝病，病人就容易出现皮下瘀点，就是因为这个凝血功能障碍的原因。然后肝脏是合成尿素的一个主要器官，合成尿素就是把一些人体代谢的氨基酸合成尿素排出体内的过程。
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