板蓝根含靛蓝、靛玉红、β-谷甾醇、γ-谷甾醇以及多种氨基酸。还含黑芥子甙、靛甙、色胺酮、1-硫氰酸-2-羟基丁-3-烯、表告伊春、腺甙、棕榈酸、蔗糖和含有12％氨基酸的蛋白多糖。

1、板蓝根所含有的吲哚类化合物有抗菌作用;有抗流感病毒、肝炎病毒等作用。

2、板蓝根含有的靛玉红有抗肿瘤作用，并可以破坏白血病细胞有显著的抗白血病等作用。

3、板蓝根多糖能够显著促进小鼠免疫功能及增强抗体形成细胞功能。

4、板蓝根有一定的抑制血小板聚集作用。

5、此外，板蓝根内含有多种抗病毒物质，对感冒病毒、腮腺炎病毒、肝炎病毒及流脑病毒等有较强的抑制和杀灭作用。